Ксения Раппопорт родилась 25 марта 1974 года в Ленинграде. Ее семья - семья коренных петербургских интеллигентов: ее мама — инженер, папа — архитектор, дедушка был археологом, а бабушка - реставратором. Ксения училась в школе с углублённым изучением французского языка, занималась музыкой и спортом (особенно успешно – художественной гимнастикой), увлекалась кукольным театром.

В 15 лет она приняла участие в съемках трагикомедии о еврейском погроме «Изыди!», первой полнометражной картине Дмитрия Астрахана. Работа на площадке с профессиональными актерами произвела на Ксению огромное впечатление, и она решила стать актрисой.

Ксения поступила в Санкт-Петербургскую государственную академию театрального искусства (СПбГАТИ) на курс В. М. Фильштинского. Несомненные способности молодой актрисы были вскоре отмечены - она была приглашена в стажёрскую группу Санкт-Петербургского Малого драматического театра и очень успешно выступала в спектакле «Дядя Ваня». После окончания учебы (2000 г.) Ксения Раппопорт стала актрисой труппы Санкт-Петербургского Малого драматического театра (ныне Малый драматический театр — Театр Европы), играла и в настоящее время играет на его сцене в спектаклях «Дядя Ваня», «Чайка», «Пьеса без названия (А.П.Чехов), «Клаустрофобия» (по пр. В.Сорокина, М.Харитонова, Л.Улицкой и др., реж. Л.Додин), «Царь Эдип» (по тр. Софокла, реж. Л. Додин). Ксения играла также в петербургском театре «На Литейном».

Ксения Раппопорт – актриса большого драматического диапазона, с прекрасным чувством стиля. Ей прекрасно удаются острохарактерные комические, драматические и трагикомические роли, она тонкая актриса психологических интеллектуальных драм. У нее запоминающийся глубокий актерский голос. Среди более 40 ролей, сыгранных ею в кино нет актерских повторов, в каждом образе она открывается зрителю по-новому.

Еще студенткой Ксения активно снималась в популярных сериалах конца 90-х («Улицы разбитых фонарей 2», «Агент национальной безопасности», Убойная сила) и в злободневных кинодрамах эпохи перестройки («Русская невеста» (1993), «Прохиндиада 2» (1994), «Цветы календулы» (1999) и др. К этому же времени относится и ее первый опыт съемок в зарубежном проекте – роль Марии в американской картине «Анна Каренина» (1997, реж. Бернард Роуз), экранизации романа Л.Н.Толстого, с Софией Марсо и Шоном Пенном в главных ролях.

С начала 2000-х гг. Ксения Раппопорт сыграла десятки замечательных киноролей: в исторической драме Карена Шахназарова «Всадник по имени Смерть» (Эрна, террористка начала ХХ века), в историческом криминальном сериале «Казароза» (оперная певица 1920-х гг.), в сериале «Есенин» (Галина Бениславская, женщина, влюбленная в великого поэта), в драме Кирилла Серебренникова «Юрьев день» (оперная певица Любовь Павловна), в остросюжетной мелодраме Антона Сиверса «Качели» (преподавательница балета), в историческом фильме «Савва Морозов» (актриса МХАТа Мария Андреевна), в сериале «Ликвидация» (Ида Казимировна Кашетинская), в лирической комедии Авдотьи Смирновой «Два дня» (Маша, зам. директора музея-заповедника), в социальных кинопроектах «Сказка-XXI» (завуч Галина Дмитриевна) и «После школы» (Жанна Ивановна, завуч и преподаватель испанского) и мн. др.

Ксения Раппопорт – одна из немногих российских актрис, востребованных в зарубежном кино. Она снялась в итальянских картинах «Незнакомка» («La Sconosciuta», 2006, реж. Дж. Торнаторе), «Человек, который любит» (L'uomo che ama, 2008, реж. Мария Соле Тоньяцци), «Итальянцы» (Italians, 2009, реж. Дж. Веронезе), «Двойной час» (La doppia ora, 2009, реж. Дж. Капотонди), «Роман моей жены» (Le roman de ma femme , 2011, реж. Дж. Усмонов) и др. Ее работа была отмечена несколькими престижными европейскими кинопремиями. 27 августа 2008 года Ксения Раппопорт вела церемонию открытия 65-го Венецианского кинофестиваля.

Ксения активно занимается благотворительностью, она - попечитель фонда «БЭЛА», помогающего детям-«бабочкам» (больные буллёзным эпидермолизом).